Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF7Q6Q0C0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF7Q6Q0C0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF7Q6Q0C0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms