Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKN3Q6P5Z2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKN3Q6P5Z2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 360.6 ms