Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD5Q6GMV2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMYD5Q6GMV2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD5Q6GMV2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMYD5Q6GMV2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SMYD5Q6GMV2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMYD5Q6GMV2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMYD5Q6GMV2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMYD5Q6GMV2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms