Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCTP1Q6DN14 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCTP1Q6DN14 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCTP1Q6DN14 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms