Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN12

MCTP2, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP2Q6DN12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCTP2Q6DN12 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCTP2Q6DN12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCTP2Q6DN12 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCTP2Q6DN12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCTP2Q6DN12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MCTP2Q6DN12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MCTP2Q6DN12 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCTP2Q6DN12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCTP2Q6DN12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MCTP2Q6DN12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCTP2Q6DN12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms