Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LPCAT4Q643R3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPCAT4Q643R3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms