Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
C9orf84Q5VXU9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
C9orf84Q5VXU9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
C9orf84Q5VXU9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
C9orf84Q5VXU9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
C9orf84Q5VXU9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms