Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATRNL1Q5VV63 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATRNL1Q5VV63 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATRNL1Q5VV63 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATRNL1Q5VV63 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms