Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRCH2Q5VUJ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRCH2Q5VUJ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRCH2Q5VUJ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms