Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRC38Q5VT99 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC38Q5VT99 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC38Q5VT99 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms