Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF5Q5TYX0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF5Q5TYX0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms