Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDSS1Q5T2R2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDSS1Q5T2R2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDSS1Q5T2R2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms