Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC38Q5R3I4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC38Q5R3I4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC38Q5R3I4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC38Q5R3I4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC38Q5R3I4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC38Q5R3I4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC38Q5R3I4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC38Q5R3I4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC38Q5R3I4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC38Q5R3I4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC38Q5R3I4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC38Q5R3I4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms