Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD3Q5JV73 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMPD3Q5JV73 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD3Q5JV73 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD3Q5JV73 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms