Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNT1Q5JUK3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT1Q5JUK3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms