Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDK2Q58EX2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK2Q58EX2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms