Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ALFQ53S48 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALFQ53S48 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALFQ53S48 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALFQ53S48 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms