Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDCA8Q53HL2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CDCA8Q53HL2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDCA8Q53HL2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDCA8Q53HL2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms