Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GREB1Q4ZG55 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GREB1Q4ZG55 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GREB1Q4ZG55 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms