Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGTA1PQ4G0N0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGTA1PQ4G0N0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGTA1PQ4G0N0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGTA1PQ4G0N0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGTA1PQ4G0N0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGTA1PQ4G0N0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGTA1PQ4G0N0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GGTA1PQ4G0N0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGTA1PQ4G0N0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms