Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TIMM50Q3ZCQ8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TIMM50Q3ZCQ8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMM50Q3ZCQ8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms