Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCTN1Q2MV58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TCTN1Q2MV58 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCTN1Q2MV58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms