Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMN1Q16637 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMN1Q16637 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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