Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB1Q16558 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNMB1Q16558 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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