Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETFDHQ16134 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ETFDHQ16134 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETFDHQ16134 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms