Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZFHX3Q15911 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms