Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6AP1Q15904 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6AP1Q15904 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6AP1Q15904 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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