Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
JMJD1CQ15652 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JMJD1CQ15652 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms