Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPAQ15257 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPAQ15257 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PTPAQ15257 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPAQ15257 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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