Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPNMBQ14956 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPNMBQ14956 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GPNMBQ14956 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GPNMBQ14956 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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