Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HNF4GQ14541 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HNF4GQ14541 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNF4GQ14541 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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