Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT33BQ14525 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT33BQ14525 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT33BQ14525 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT33BQ14525 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT33BQ14525 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT33BQ14525 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT33BQ14525 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT33BQ14525 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT33BQ14525 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT33BQ14525 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT33BQ14525 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms