Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NID2Q14112 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NID2Q14112 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NID2Q14112 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NID2Q14112 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NID2Q14112 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NID2Q14112 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NID2Q14112 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NID2Q14112 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NID2Q14112 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NID2Q14112 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NID2Q14112 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NID2Q14112 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NID2Q14112 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NID2Q14112 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NID2Q14112 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NID2Q14112 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NID2Q14112 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NID2Q14112 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NID2Q14112 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NID2Q14112 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NID2Q14112 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NID2Q14112 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NID2Q14112 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NID2Q14112 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NID2Q14112 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NID2Q14112 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NID2Q14112 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NID2Q14112 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NID2Q14112 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NID2Q14112 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NID2Q14112 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NID2Q14112 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NID2Q14112 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NID2Q14112 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NID2Q14112 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NID2Q14112 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NID2Q14112 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NID2Q14112 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NID2Q14112 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NID2Q14112 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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NID2Q14112 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NID2Q14112 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NID2Q14112 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NID2Q14112 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NID2Q14112 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NID2Q14112 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NID2Q14112 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NID2Q14112 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NID2Q14112 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NID2Q14112 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NID2Q14112 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NID2Q14112 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
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NID2Q14112 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NID2Q14112 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NID2Q14112 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
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NID2Q14112 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NID2Q14112 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NID2Q14112 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NID2Q14112 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NID2Q14112 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NID2Q14112 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NID2Q14112 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NID2Q14112 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NID2Q14112 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NID2Q14112 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NID2Q14112 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NID2Q14112 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NID2Q14112 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NID2Q14112 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NID2Q14112 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NID2Q14112 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NID2Q14112 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NID2Q14112 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NID2Q14112 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NID2Q14112 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NID2Q14112 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NID2Q14112 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NID2Q14112 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NID2Q14112 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NID2Q14112 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NID2Q14112 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
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