Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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