Protein–RNA interactions for Protein: Q14061

COX17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX17Q14061 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX17Q14061 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX17Q14061 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COX17Q14061 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX17Q14061 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX17Q14061 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX17Q14061 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX17Q14061 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX17Q14061 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX17Q14061 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX17Q14061 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX17Q14061 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX17Q14061 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX17Q14061 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX17Q14061 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX17Q14061 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX17Q14061 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX17Q14061 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX17Q14061 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX17Q14061 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX17Q14061 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX17Q14061 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX17Q14061 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX17Q14061 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX17Q14061 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX17Q14061 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX17Q14061 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX17Q14061 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX17Q14061 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX17Q14061 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COX17Q14061 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX17Q14061 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX17Q14061 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX17Q14061 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX17Q14061 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX17Q14061 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX17Q14061 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX17Q14061 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX17Q14061 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX17Q14061 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX17Q14061 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX17Q14061 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX17Q14061 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX17Q14061 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX17Q14061 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX17Q14061 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX17Q14061 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX17Q14061 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX17Q14061 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX17Q14061 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX17Q14061 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX17Q14061 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COX17Q14061 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX17Q14061 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX17Q14061 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX17Q14061 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX17Q14061 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX17Q14061 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX17Q14061 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX17Q14061 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX17Q14061 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COX17Q14061 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX17Q14061 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX17Q14061 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX17Q14061 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX17Q14061 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX17Q14061 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX17Q14061 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COX17Q14061 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX17Q14061 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX17Q14061 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX17Q14061 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX17Q14061 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX17Q14061 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX17Q14061 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX17Q14061 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX17Q14061 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX17Q14061 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX17Q14061 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX17Q14061 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX17Q14061 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX17Q14061 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX17Q14061 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX17Q14061 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX17Q14061 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COX17Q14061 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX17Q14061 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX17Q14061 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX17Q14061 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX17Q14061 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX17Q14061 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX17Q14061 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX17Q14061 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX17Q14061 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX17Q14061 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COX17Q14061 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX17Q14061 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX17Q14061 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX17Q14061 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COX17Q14061 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms