Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRQ13535 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRQ13535 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRQ13535 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRQ13535 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRQ13535 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRQ13535 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRQ13535 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRQ13535 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRQ13535 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRQ13535 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRQ13535 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRQ13535 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRQ13535 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRQ13535 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRQ13535 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRQ13535 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRQ13535 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRQ13535 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRQ13535 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRQ13535 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRQ13535 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRQ13535 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRQ13535 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRQ13535 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRQ13535 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRQ13535 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRQ13535 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRQ13535 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRQ13535 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRQ13535 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRQ13535 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATRQ13535 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATRQ13535 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATRQ13535 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATRQ13535 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATRQ13535 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATRQ13535 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATRQ13535 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATRQ13535 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATRQ13535 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATRQ13535 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRQ13535 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRQ13535 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRQ13535 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRQ13535 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRQ13535 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRQ13535 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRQ13535 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRQ13535 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRQ13535 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRQ13535 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRQ13535 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRQ13535 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRQ13535 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRQ13535 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRQ13535 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRQ13535 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRQ13535 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRQ13535 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRQ13535 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRQ13535 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRQ13535 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRQ13535 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRQ13535 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRQ13535 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRQ13535 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRQ13535 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRQ13535 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRQ13535 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRQ13535 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRQ13535 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRQ13535 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRQ13535 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRQ13535 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRQ13535 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRQ13535 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRQ13535 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRQ13535 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRQ13535 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRQ13535 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRQ13535 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRQ13535 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRQ13535 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRQ13535 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRQ13535 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRQ13535 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRQ13535 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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