Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TUSC3Q13454 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUSC3Q13454 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUSC3Q13454 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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