Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IKZF1Q13422 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IKZF1Q13422 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IKZF1Q13422 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IKZF1Q13422 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IKZF1Q13422 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IKZF1Q13422 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IKZF1Q13422 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IKZF1Q13422 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IKZF1Q13422 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IKZF1Q13422 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IKZF1Q13422 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IKZF1Q13422 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IKZF1Q13422 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IKZF1Q13422 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKZF1Q13422 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IKZF1Q13422 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKZF1Q13422 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKZF1Q13422 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKZF1Q13422 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKZF1Q13422 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IKZF1Q13422 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IKZF1Q13422 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IKZF1Q13422 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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