Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL49Q13405 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
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