Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NME3Q13232 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NME3Q13232 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NME3Q13232 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NME3Q13232 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NME3Q13232 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NME3Q13232 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NME3Q13232 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NME3Q13232 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NME3Q13232 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME3Q13232 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME3Q13232 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME3Q13232 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME3Q13232 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NME3Q13232 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME3Q13232 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME3Q13232 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME3Q13232 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME3Q13232 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME3Q13232 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME3Q13232 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME3Q13232 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME3Q13232 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME3Q13232 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME3Q13232 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NME3Q13232 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME3Q13232 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME3Q13232 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME3Q13232 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NME3Q13232 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NME3Q13232 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NME3Q13232 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NME3Q13232 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NME3Q13232 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME3Q13232 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NME3Q13232 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME3Q13232 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME3Q13232 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME3Q13232 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME3Q13232 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME3Q13232 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME3Q13232 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME3Q13232 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME3Q13232 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME3Q13232 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME3Q13232 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME3Q13232 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME3Q13232 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME3Q13232 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME3Q13232 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME3Q13232 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NME3Q13232 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME3Q13232 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME3Q13232 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME3Q13232 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME3Q13232 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME3Q13232 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME3Q13232 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NME3Q13232 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME3Q13232 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME3Q13232 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME3Q13232 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME3Q13232 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME3Q13232 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME3Q13232 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME3Q13232 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME3Q13232 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME3Q13232 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME3Q13232 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME3Q13232 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME3Q13232 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME3Q13232 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME3Q13232 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME3Q13232 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME3Q13232 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME3Q13232 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME3Q13232 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME3Q13232 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME3Q13232 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME3Q13232 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME3Q13232 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME3Q13232 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME3Q13232 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NME3Q13232 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME3Q13232 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME3Q13232 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NME3Q13232 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NME3Q13232 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NME3Q13232 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME3Q13232 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME3Q13232 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME3Q13232 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME3Q13232 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME3Q13232 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME3Q13232 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME3Q13232 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME3Q13232 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NME3Q13232 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME3Q13232 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NME3Q13232 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
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