Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPS1Q13098 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPS1Q13098 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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