Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
MRPL28Q13084 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL28Q13084 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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