Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF2Q12933 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAF2Q12933 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF2Q12933 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms