Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPN13Q12923 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN13Q12923 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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