Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TP53BP1Q12888 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TP53BP1Q12888 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53BP1Q12888 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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