Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX4Q12846 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX4Q12846 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX4Q12846 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX4Q12846 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX4Q12846 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX4Q12846 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX4Q12846 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX4Q12846 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX4Q12846 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX4Q12846 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX4Q12846 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX4Q12846 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX4Q12846 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STX4Q12846 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX4Q12846 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX4Q12846 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX4Q12846 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STX4Q12846 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX4Q12846 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX4Q12846 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX4Q12846 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX4Q12846 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX4Q12846 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX4Q12846 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX4Q12846 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX4Q12846 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX4Q12846 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX4Q12846 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX4Q12846 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX4Q12846 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX4Q12846 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX4Q12846 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX4Q12846 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX4Q12846 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX4Q12846 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX4Q12846 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX4Q12846 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX4Q12846 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX4Q12846 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STX4Q12846 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STX4Q12846 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STX4Q12846 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX4Q12846 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX4Q12846 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX4Q12846 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX4Q12846 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX4Q12846 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX4Q12846 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX4Q12846 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX4Q12846 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX4Q12846 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX4Q12846 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX4Q12846 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX4Q12846 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX4Q12846 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX4Q12846 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX4Q12846 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX4Q12846 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX4Q12846 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX4Q12846 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX4Q12846 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX4Q12846 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX4Q12846 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX4Q12846 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX4Q12846 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX4Q12846 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX4Q12846 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
STX4Q12846 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX4Q12846 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX4Q12846 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX4Q12846 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX4Q12846 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX4Q12846 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX4Q12846 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX4Q12846 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX4Q12846 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX4Q12846 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX4Q12846 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX4Q12846 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX4Q12846 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX4Q12846 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX4Q12846 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX4Q12846 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX4Q12846 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX4Q12846 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX4Q12846 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX4Q12846 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX4Q12846 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX4Q12846 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX4Q12846 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX4Q12846 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX4Q12846 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX4Q12846 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX4Q12846 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX4Q12846 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX4Q12846 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX4Q12846 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX4Q12846 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX4Q12846 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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