Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CPSF1Q10570 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CPSF1Q10570 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CPSF1Q10570 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms