Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFFO1Q0D2I5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFFO1Q0D2I5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFFO1Q0D2I5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms