Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SSRP1Q08945 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSRP1Q08945 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSRP1Q08945 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSRP1Q08945 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSRP1Q08945 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSRP1Q08945 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms