Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC63Q05C16 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC63Q05C16 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC63Q05C16 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms